关键词:
磁共振成像
肝细胞癌
影像组学
深度学习
Ki-67
磁共振成像
肝细胞癌
影像组学
深度学习
微血管密度
摘要:
目的 探讨基于多模态MRI的传统机器学习方法及深度学习方法术前预测肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)Ki-67表达的价值。
材料与方法 回顾性收集2016年1月2023年3月于我院行1.5T或3.0T MRI检查且术后病理证实为HCC的患者87例,包括T2WI、扩散加权成像(diffusion-weighted imaging,DWI)及动态增强序列。根据免疫组化染色情况,分为Ki-67高表达组(阳性细胞比例>15%,n=45),Ki-67低表达组(阳性细胞比例≤15%,n=42)。按8:2比例将所有患者随机分为训练集和测试集,其中训练集中Ki-67高表达组35例,Ki-67低表达组34例;测试集中Ki-67高表达组10例,Ki-67低表达组8例。使用GE AW 4.6工作站Functool软件对所有患者DWI序列进行后处理,获得表观扩散系数(Apparent diffusion coefficient,ADC)图。将T2WI、ADC、动脉期(arterial phase,AP)及门静脉期(portal venous phase,PVP)图像导入ITK-SNAP软件(version 3.6.0,http://***/),逐层沿肿瘤边缘勾画感兴趣区(regions of interest,ROI),经融合获得肿瘤全域感兴趣容积(volume of interest,VOI)。在所有数据集中随机抽取30例患者,分别由具有3年及9年的影像诊断经验的放射科医师完成所有序列ROI的勾画,以评估影像组学特征在观察者内和观察者间的一致性。使用Python语言的Pyradiomics包,每个序列提取107个纹理特征,包括一阶特征、形状特征、灰度共生矩阵(gray level co-occurrence matrix,GLCM)、灰度依赖矩阵(gray level dependence matrix,GLDM)、灰度大小矩阵(gray level size zone matrix,GLSZM)、灰度游程矩阵(gray level run length matrix,GLRLM)及邻域灰度差矩阵(neighbouring gray tone difference matrix,NGTDM)。使用组内相关系数(intraclass correlation coefficients,ICCs)及独立样本t检验进行特征降维。通过5折交叉验证,使用传统机器学习分类器逻辑回归构建影像组学模型。收集患者临床资料及常规放射学特征,包括患者的性别、年龄、肝炎病史、甲胎蛋白(alpha-foetoprotein,AFP)、丙氨酸氨基转移酶(alanine aminotransferase,ALT)、天冬氨酸氨基转移酶(aspartate transaminase,AST)、谷氨酰转肽酶(γ-glutamyltranspeptidase,GGT)、碱性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)、总胆红素(total bilirubin,T-BIL)、白蛋白(albumin,ALB)、Child-Pugh分级(A级或B级)、肿瘤形状、肿瘤直径、肿瘤数目、肿瘤边缘、肿瘤内坏死、肿瘤内出血、肿瘤内脂肪、包膜强化、瘤周强化、肿瘤内动脉及影像学肝硬化,采用单因素及多因素logistic回归分析筛选HCC Ki-67表达的临床放射学独立预测因素,基于独立预测因素建立临床放射模型。将从影像组学模型中获得的影像组学特征和临床放射因素相结合,建立临床放射-影像组学联合模型。使用Antspy的Quick Rigid配准将T2WI、ADC及PVP图像分别配准到AP图像。将每个序列图像及肿瘤ROI输入预训练的卷积神经网络(convolutional neural network,CNN)。使用Res Net网络架构构建深度学习模型。将深度学习特征、降维得到的影像组学特征及临床放射特征输入到全连接层中,通过Res Net架构进行联合训练,并进一步构建深度学习与影像组学和临床放射融合模型(简称“融合模型”)。采用R语言、Python语言及SPSS26.0进行统计分析。临床放射特征中的变量采用卡方检验或Fisher精确检验进行分析。采用受试者工作特征曲线(receiver operating characteristic curve,ROC)评估不同模型预测效能,得到准确性、敏感度和特异度,并计算曲线下面积(area under curve,AUC)。采用Delong检验比较不同预测模型的AUC,P<0.05认为差异有统计学意义。
结果 基于传统机器学习方法的多模态MRI影像组学模型在训练集中的AUC、准确性、敏感度、